Dopo cinque anni il regime imposto da Superman e parte della Justice League dopo che il Joker aveva sterminato Metropolis con un'arma nucleare e che per questo era stato ucciso a sangue freddo proprio dall'Uomo d'Acciaio, è stato finalmente sconfitto dalla resistenza messa su da Batman. Nel frattempo molti eroi sono morti o sono spariti, ma almeno Superman è stato rinchiuso in una cella potenziata dall'energia di un sole rosso. E mentre il Cavaliere Oscuro e i suoi alleati cercano un modo per riportare le cose alla normalità, il Dottor Fate ha riportato indietro Black Canary e suo figlio Connor oltre all'Oliver Queen di un altro universo con il quale ha vissuto felicemente per alcuni anni. Ma una nuova minaccia si è affacciata all'orizzonte, con un nuovo e misterioso Batman omicida, il quale ha reclutato una nuova Suicide Squad, compresa una recalcitrante Harley Quinn, diventata buona. Chi è questo nuovo Batman e qual è il suo obiettivo? A seguire la seconda parte del crossover tra l'universo di Injustice e quello dei Masters of the Universe, ambientato cinque anni nel futuro. Superman è tornato a capo del mondo grazie alla tecnologia aliena di Brainiac e all'inaspettato aiuto di un depotenziato Skeletor, e gli eroi della resistenza hanno individuato He-Man e la sua fonte magica del potere come la loro ultima possibile occasione. Ma nel frattempo Darkseid è arrivato nei pressi di Eternia, pronto a conquistare il pianeta!